Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms