Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
A0A0U1RNP2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms