Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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