Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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