Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm26992S4R1A3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm26992S4R1A3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms