Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Top3bQ9Z321 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Top3bQ9Z321 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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