Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms