Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Pfdn5Q9WU28 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Pfdn5Q9WU28 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Pfdn5Q9WU28 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Pfdn5Q9WU28 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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