Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms