Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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Col4a3Q9QZS0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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