Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rdh11Q9QYF1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rdh11Q9QYF1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rdh11Q9QYF1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rdh11Q9QYF1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rdh11Q9QYF1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
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Rdh11Q9QYF1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Rdh11Q9QYF1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Rdh11Q9QYF1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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