Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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