Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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