Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms