Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Col5a3Q9JLI2 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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