Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms