Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms