Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms