Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms