Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Med27Q9DB40 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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