Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PacrgQ9DAK2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms