Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ift43Q9DA69 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ift43Q9DA69 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ift43Q9DA69 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ift43Q9DA69 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ift43Q9DA69 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ift43Q9DA69 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ift43Q9DA69 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ift43Q9DA69 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 686 ms