Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms