Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pdzd9Q9D9M4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pdzd9Q9D9M4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pdzd9Q9D9M4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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