Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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