Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Snx5Q9D8U8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Snx5Q9D8U8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Snx5Q9D8U8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Snx5Q9D8U8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Snx5Q9D8U8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Snx5Q9D8U8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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