Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn23Q9D7D7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn23Q9D7D7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn23Q9D7D7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn23Q9D7D7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
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Cldn23Q9D7D7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn23Q9D7D7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn23Q9D7D7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn23Q9D7D7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn23Q9D7D7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn23Q9D7D7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Cldn23Q9D7D7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Cldn23Q9D7D7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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