Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms