Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms