Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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