Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms