Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms