Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms