Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms