Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms