Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms