Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms