Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms