Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms