Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ifitm3Q9CQW9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ifitm3Q9CQW9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ifitm3Q9CQW9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ifitm3Q9CQW9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ifitm3Q9CQW9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ifitm3Q9CQW9 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ifitm3Q9CQW9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ifitm3Q9CQW9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ifitm3Q9CQW9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ifitm3Q9CQW9 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifitm3Q9CQW9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms