Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms