Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms