Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms