Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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