Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl17Q9CPR4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl17Q9CPR4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl17Q9CPR4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl17Q9CPR4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl17Q9CPR4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl17Q9CPR4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms