Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms