Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RetnQ99P87 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RetnQ99P87 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RetnQ99P87 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RetnQ99P87 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
RetnQ99P87 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RetnQ99P87 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RetnQ99P87 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms