Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms