Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms