Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms